Contoh elemen portabel yang melacak perkembangan kanker pada data yang diselesaikan secara spasial. Warna hijau merupakan epitel normal, warna coklat merupakan lesi bergerigi, dan warna merah merupakan daerah tumor. Panah menunjukkan transformasi patologis antara wilayah-wilayah ini. Kredit: Valdebenito-Maturana B. Laporan Ilmiah (2024). DOI: 10.1038/s41598-024-73744-7
Kanker lambung (GC) merupakan keganasan mematikan yang terjadi di seluruh dunia dan dianggap endemik di negara-negara di Asia Timur, Eropa Timur, dan Amerika Selatan. Memang benar, di negara asal saya, Chili, GC adalah penyebab utama kematian akibat kanker pada pria.
Masalah utama dengan GC adalah seringnya terdeteksi pada stadium lanjut, ketika tingkat kelangsungan hidup kurang dari 10%. Sebaliknya, tingkat kelangsungan hidup kasus GC awal bisa mencapai 90%. Hal ini menyebabkan perlunya metode baru untuk deteksi dini dan tepat waktu.
Elemen transposable (TE), yang disebut “gen pelompat”, jarang dipelajari karena kesulitan komputasi. Namun, dalam beberapa tahun terakhir terdapat peningkatan penelitian yang berfokus pada peran TE dalam berbagai jenis kanker. Namun, pengaruhnya belum pernah diteliti sebelumnya untuk GC.
Dalam karya terbaru saya, yang sekarang diterbitkan di Scientific Reports, saya menemukan bahwa ekspresi TE adalah ciri khas GC dan aktivitasnya dapat dikaitkan dengan perolehan status ganas atau “tumor”.
Penjelasan Dasar tentang 'Gen yang Melompat'
Genom manusia memiliki panjang sekitar 3 miliar basa, tetapi hanya sekitar 1% yang sesuai dengan gen pengkode protein. Sebaliknya, hampir 50% genom manusia berhubungan dengan elemen transposable, yang merupakan elemen yang sangat berulang karena sifatnya yang “melompat”: TE memiliki kemampuan untuk mereplikasi dan bergerak di sekitar genom.
Mereka awalnya diberi label sebagai “DNA sampah” karena sifat parasit dan egois mereka yang hanya membuat lebih banyak salinan. Barbara McClintock memelopori penelitian yang menemukan bahwa TE memainkan peran penting dalam pengendalian ekspresi gen, sehingga ia dianugerahi Hadiah Nobel pada tahun 1983.
Sekarang telah diketahui bahwa TE dapat terlibat dalam regulasi gen dalam kondisi kesehatan dan penyakit, seperti yang telah dilaporkan oleh saya dan banyak kelompok lainnya. Hal ini dimungkinkan berkat pengembangan alat komputasi untuk mempelajarinya, suatu bidang yang saya dan beberapa laboratorium telah berkontribusi.
Hasil analisis inferensi lintasan menunjukkan adanya unsur transposable yang diekspresikan dalam garis sel ganas. Kiri, jalur diwarnai oleh keganasan yang diukur dengan skor inferCNV, dan kanan, ekspresi elemen transposable di seluruh jalur. Kredit: Valdebenito-Maturana B. Laporan Ilmiah (2024). DOI: 10.1038/s41598-024-73744-7 Elemen transposabel pada kanker lambung
Dalam penelitian saya, saya pertama kali menggunakan data pengurutan RNA sel tunggal untuk merekonstruksi evolusi sel dari status normal menjadi ganas dan menilai apakah aktivasi TE dikaitkan dengan garis sel “tumor” ini. Selanjutnya, untuk mengkonfirmasi dan mengkarakterisasi lebih lanjut bahwa aktivasi TE adalah ciri khas GC, saya juga menilai aktivasi mereka dalam data sekuensing RNA yang diselesaikan secara spasial.
Meskipun pemodelan komputasi evolusi sel, “inferensi jalur”, suatu bidang yang banyak berkembang, belum diterapkan secara luas pada studi kanker. Menggabungkan pendekatan tersebut dengan keahlian saya di bidang TE, saya mengkarakterisasi evolusi sel GC dan menemukan bahwa 111 dari “gen lompatan” ini diaktifkan dalam garis sel ganas.
Di sisi lain, dengan data yang diselesaikan secara spasial, kita sudah melihat ekspresi di jaringan sebagaimana adanya. Di sini saya menemukan bahwa TE diaktifkan baik di daerah tumor maupun di sekitarnya (yang disebut lingkungan mikro tumor). Dalam beberapa kasus, saya bahkan menemukan bahwa TE mengikuti transisi dari daerah normal ke daerah tumor, yang semakin mendukung temuan dari bagian pertama penelitian ini.
Apa selanjutnya?
Hasil ini cukup menarik karena kita dapat melihat bahwa, mirip dengan jenis kanker lainnya, ekspresi TE juga terjadi pada kanker lambung. Selain itu, ini adalah penelitian pertama yang melaporkan bahwa unsur-unsur ini menjadi aktif pada tahap awal penyakit. Hal ini menunjukkan bahwa “gen pelompat” ini merupakan biomarker baru yang dapat dideteksi secara tepat waktu.
Langkah selanjutnya dalam penelitian ini adalah validasi eksperimental atas temuan ini, dan jika kami menemukan bahwa elemen-elemen ini terdeteksi secara konsisten pada tahap awal, kami mungkin sedang mencari pengobatan baru dan cara untuk menghentikan kanker perut.
Kisah ini adalah bagian dari Dialog Sains X, di mana peneliti dapat melaporkan temuan dari artikel penelitian yang mereka publikasikan. Kunjungi halaman ini untuk informasi tentang Dialog Sains X dan cara berpartisipasi.
Informasi lebih lanjut: Braulio Valdebenito-Maturana, Potret spasial dan seluler ekspresi elemen transposable selama kanker lambung, Laporan Ilmiah (2024). DOI: 10.1038/s41598-024-73744-7
Braulio Valdebenito-Maturana adalah ilmuwan bioinformatika, yang fokus pada pengembangan dan penerapan metode komputasi untuk meningkatkan pemahaman kita tentang mekanisme molekuler kanker lambung.
Kutipan: Melompat gen untuk deteksi dini kanker lambung (2024, 18 November) Diakses pada 18 November 2024, dari https://medicalkpress.com/nevs/2024-11-genes-early-gastric-cancer.html
Dokumen ini memiliki hak cipta. Kecuali untuk transaksi wajar untuk tujuan studi atau penelitian pribadi, tidak ada bagian yang boleh direproduksi tanpa izin tertulis. Konten disediakan untuk tujuan informasi saja.
Keluarga Bahagia
pekerjaan demi keluarga
Informasi mengenai KING SLOT, Segera Daftar Bersama king selot terbaik dan terpercaya no satu di Indonesia. Boleh mendaftar melalui sini king slot serta memberikan hasil kembali yang paling tinggi saat sekarang ini hanyalah king slot paling gacor, gilak dan gaco saat sekarang di Indonesia melalui program return tinggi di kingselot serta pg king slot
matahari88slot permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://matahari88slot.com/
mama88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://mama88.asia/
loker88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://loker88.biz/
line88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://line88.social/
lelang88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://lelang88.asia/
legend88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://legend88.org/
laundry 88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://laundry88.org/
laundry 88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://laundry88.net/
kota88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kota88.asia/
kawat88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kawat88.net/
kakaotalk permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kakaotalk.pro/
kaca88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kaca88.asia/
jualbeli88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jualbeli88.com/
indonesiafc88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://indonesiafc88.com/
indofood88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://indofood88.com/
guru88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://guru88.asia/
grabpay88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://grabpay88.org/
grab88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://grab88.info/
gopay88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://gopay88.info/
gold88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://gold88.asia/
gofood88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://gofood88.com/
gelas88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://gelas88.info/
eth88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://eth88.org/
emas88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://emas88.biz/
blockchain88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://blockchain88.net/
baik888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://baik888.net/
bagus888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://bagus888.info/
anorganik88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://anorganik88.com/
panen96 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://panen96.net/
panen96 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://panen69.info/
panen96 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://panen69.asia/
selot permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://selot.info/
selot permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://selot.asia/
samsung88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://samsung88.asia/
raksasa88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://raksasa88.info/
iphone88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://iphone88.asia/
gm88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://gm88.news/
selot permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://selot.biz/
topdewa88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://topdewa88.com/
ebook88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://ebook88.org/
ebook88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://ebook88.net/
sensor88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sensor88.asia/
mpo2288 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://mpo2288.net/
lembaga88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://lembaga88.net/
inti88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://inti88.biz/
dokumen88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://dokumen88.com/
baik88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://baik88.asia/
bagus888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://bagus888.asia/
tiktok888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://tiktok888.info/
registrasi88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://registrasi88.net/
registrasi88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://registrasi88.com/
pstmi88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://pstmi88.com/
lionsclubs88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://lionsclubs88.com/
kompas88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kompas88.asia/
jeruk333 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://jeruk333.com/
james88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://james88.net/
fb888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://fb888.site/
detik888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://detik888.asia/
david88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://david88.net/
danautoba88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://danautoba88.com/
tebar88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://tebar88.asia/
slotbom777 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://slotbom777.asia/
padi88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://padi88.com/
padi77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://padi77.asia/
muara88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://muara88.asia/
muara77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://muara77.asia/
maxwin777 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://maxwin777.asia/
bigpot888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://bigpot888.org/
bigpot888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://bigpot888.net/
sumo88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sumo88.net/
sumo77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sumo77.org/
sumo77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sumo77.net/
sjo88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sjo88.asia/
sjo77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sjo77.asia/
kudetabet88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kudetabet88.asia/
kudeta99 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kudeta99.asia/
kudeta988 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kudeta988.com/
kudeta88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://kudeta88.asia/
fufufafa permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://fufufafa.org/
bahagia88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://bahagia88.org/
bahagia77 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://bahagia77.club/
angin777 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://angin777.inf/
sunda88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://sunda88.org/
slotcc88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://slotcc88.com/
poskobet88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://poskobet88.com/
nuri88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://nuri88.asia/
janjiwin88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://janjiwin88.com/
top99 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://top99.asia/
top888 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://top888.info/
terbaik99 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://terbaik99.com/
terbaik88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://terbaik88.asia/
pornhub88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://pornhub88.org/
pornhub88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://pornhub88.com/
plastik88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://plastik88.com/
partai88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://partai88.asia/
panas88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://panas88.info/
minimal88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://minimal88.net/
minimal88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://minimal88.com/
merk88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://merk88.net/
merk88 permainan paling top dan garansi imbal balik hasil besar bersama https://merk88.com/